Υποχρεωτική είναι η συμπλήρωση του εντύπου Ε3 από τους αγρότες ανεξάρτητα από το αν τηρούν βιβλία ή όχι ή εντάσσονται στο κανονικό ή στο ειδικό καθεστώς του ΦΠΑ, ενώ έχουν τη δυνατότητα με συμπληρωματική αίτηση να δηλώσουν αναδρομικά τις επιδοτήσεις στο έτος που δημιουργήθηκε το δικαίωμα είσπραξης.
Τα παραπάνω προκύπτουν από διευκρινίσεις της υφυπουργού Οικονομικών Αικ. Παπανάτσιου σχετικά με το καθεστώς φορολογίας εισοδήματος των αγροτών.
Σύμφωνα μάλιστα με το enikonomia, με το έγγραφο της υφυπουργού που απεστάλη στη Βουλή, δεν γίνεται καμία διάκριση σχετικά με το εάν κάποιος έχει ενταχθεί ή όχι σε κάποιο από τα καθεστώτα του ΦΠΑ. Για όσους δηλώσουν εισόδημα από αγροτική επιχειρηματική δραστηριότητα είναι απαραίτητη η συμπλήρωση του εντύπου Ε3 (Πίνακας ΣΤ'), ανεξάρτητα από το αν υπάρχει απαλλαγή ή όχι από την τήρηση βιβλίων του Κ.Φ.Α.Σ. και την ένταξή τους ή όχι στο ειδικό ή στο κανονικό καθεστώς Φ.Π.Α.
Η Δ/νση Εφαρμογής Άμεσης Φορολογίας της Γ.Γ.Δ.Ε. (Α.Α.Δ.Ε.) βρίσκεται ήδη σε επικοινωνία με τη Δ/νση Πληρωμών Αγρ. Ενίσχυσης του υπουργείου Αγροτικής Ανάπτυξης ούτως ώστε οι βεβαιώσεις που θα χορηγεί ο ΟΠΕΚΕΠΕ θα φέρουν τους απαραίτητους χαρακτηρισμούς για την ορθή φορολογική αντιμετώπιση των αγροτικών επιδοτήσεων.